Kropparna, som låg nedpackade i över hundra svarta sopsäckar, upptäcktes tidigare i september efter att boende i närheten börjat klaga på lukten.
Delstaten är hårt drabbad av droghandel och gängkriminalitet och massgraven utanför storstaden Guadalajara är den andra som upptäckts i Jalisco år. I maj hittades kvarlevorna från 35 personer nedgrävda vid en bondgård.
Många av kropparna var styckade och kriminaltekniker har tvingats para ihop kroppsdelarna för att kunna identifiera offren.
Utrikes
15.9.2019
Över 40 kroppar identifierade i brunn i Mexiko
Kvarlevorna från 44 människor som hittades i en brunn i delstaten Jalisco i Mexiko har identifierats, skriver BBC.